Hvad er en proksimal Promoter?

En proksimal promotor er en region i deoxyribonukleinsyre (DNA) lige før begyndelsen af ​​et gen, hvor proteiner og andre molekyler binder i forberedelse til at læse dette gen. Promotorområdet er afgørende for de fleste gener, der skal læses og transkriberes til protein, både simple prokaryote celler og de mere komplekse eukaryoter. En række af proteiner kaldet transkriptionsfaktorer binder til DNA i denne region, og de udføre mange opgaver forbereder gentranskription. Den vigtigste af disse funktioner er at opbygge et stillads af proteiner, som besidder DNA-åben og transkriberer den korrekte gen på samme tid.

Den nøjagtige placering og struktur af en proksimal promotor varierer mellem gener og celletyper. Prokaryote celler, dem med ingen kerne, har sædvanligvis en type af promotor, mens eukaryotiske celler, dem med en sand kerne, har en anden. Promotorer normalt ligge et par nukleotider opstrøms for eller før det gen, de kontrollerer. Næsten hver promotor indeholder en særlig sekvens af nukleotider, der identificerer det som sådan. I almindelighed er prokaryote promotorer identificeres af en gruppe af nukleotider kaldes Shine-Dalgarno-sekvensen, og eukaryote promotorer er identificeret ved en specifik genetisk sekvens kaldet TATA-boksen.

På trods af disse forholdsvis simple regler, ikke hver proksimale promotor følger dem, hvilket kan gøre at identificere dem, og de gener, de kontrollerer, noget vanskeligt. Afstanden mellem en promotor og dens gen er ikke fast inden for en art eller inden for en enkelt organisme, så at bestemme, hvor de sidder i forhold til hinanden, er ikke trivielt. Proksimal promotorsekvens sammensætninger ikke altid er identiske; kan de meget i længde, sammensætning eller begge dele. Desuden markørsekvenserne af Shine-Dalgarno box eller TATA-boksen har nogle variation i dem. Hvordan de forskellige transkriptionsfaktorer genkende promotorer i lyset af denne iboende variation er ikke let at afgøre, og nye eksempler synes ofte, at rejser tvivl om disse tidligere robuste løsninger.

Når et gen er meget tæt på et andet gen, eksisterer muligheden for, at dens proximale promotor kunne påvirkes af virkningen af ​​den nærliggende genet. Nogle gange sker det med vilje i genomet, måske for at stimulere flere gener på én gang eller regulere deres indsats samtidig. På andre tidspunkter, er en forbindelse mellem to gener gennem en promotor aktivitet gjort fejl. For at forhindre dette krydstale mellem gener, hvor det ikke er berettiget, nogle genomer har isolerende regioner mellem dem. Denne ekstra region er ikke altid nødvendigt, og nogle genomer forhindre krydstale ved gen-positionering på andre måder, som tvinger et gen til at være inaktive, mens en anden er aktiv.

  • Både prokaryote og eukaryote celler har proximale promotorer.
  • Forskellige proteiner kaldet transkriptionsfaktorer binder til DNA i den proximale promotorregion.

© 2020 Zajacperrone.com | Contact us: webmaster# zajacperrone.com